疑似病例完成新冠病毒全基因組分析僅需半小時
發(fā)布時間：2020-03-04 09:27:26瀏覽次數(shù)：5169
當(dāng)前，針對新型冠狀病毒的主要檢測技術(shù)有免疫、PCR和高通量測序(NGS)三類，其中免疫和PCR方法是一種定向檢測，可以對病毒進(jìn)行篩查，適合對患者標(biāo)本中是否存在病毒進(jìn)行診斷。
高通量測序作為一種全面的基因組檢測技術(shù)，雖然它可以有效防止病毒變異產(chǎn)生的漏檢，但因?qū)嶒灹鞒毯臅r長，操作繁瑣，尤其是建庫環(huán)節(jié)步驟繁瑣，需要多次轉(zhuǎn)管和移液操作，致使其推廣應(yīng)用受到限制。
基于此，杰毅生物、浙江省疾控中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊一同聯(lián)手，研發(fā)出中國首臺宏基因組全自動建庫設(shè)備Cubics。據(jù)悉，該平臺是不同于核酸檢測方法的全基因組檢測技術(shù)，借助AI算法對基因數(shù)據(jù)的海量分析處理能力，能對疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列分析比對；同時配備基于自主研發(fā)的CNAD技術(shù)（CRISPR等溫檢測法）研制的針對新型冠狀病毒的試劑盒。并且，該檢測試劑盒不依賴PCR儀器，能快速有效地解決醫(yī)院單位現(xiàn)場反應(yīng)需求，實現(xiàn)快速尋找病原，并進(jìn)行感染診斷。
不過，因全基因組檢測技術(shù)是對疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列對比，每次測序過程會產(chǎn)生海量的數(shù)據(jù)，其前處理和數(shù)據(jù)分析都非常費時費力。為此，該平臺還借助阿里達(dá)摩院的AI算法加持，在序列比對過程中，對算法增加了分布式設(shè)計。
據(jù)了解，與傳統(tǒng)新冠肺炎的分析檢測，該平臺至少能夠節(jié)省8個小時的分析檢測時間，僅需半小時就能將疑似病例完成新冠病毒全基因組分析，可以實現(xiàn)快速精準(zhǔn)捕捉變異后的病毒序列，二級結(jié)構(gòu)及三維結(jié)構(gòu)，進(jìn)而精準(zhǔn)檢測變異病毒，大幅提高疑似病例的確診速度。(生物谷Bioon.com）
